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高圣沙龙第930期 · 出生缺陷基因检测的未来——NIPT PLUS

时间:2020-03-23 16:53
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3月20日,受疫情影响,沙龙依然在企业微信直播平台上进行。高圣沙龙来了一位人气颇高的大咖主讲,优迅医学轮值COO & 生物信息总监张静波先生空降直播间。本次沙龙的主题为:出生缺陷基因检测的未来——NIPT PLUS。

张静波先生拥有13年生物信息分析及遗传统计学学习及工作经历,主要研究方向为NGS应用型产品核心算法设计及基因组学大数据分析,带领团队完成中国耳聋基因单倍型分析、NIPT贝叶斯方法核心设计、基于常染色体胎儿浓度定量算法、ESRiT、TMB、信息熵疾病风险评估模型等核心算法,已发表高质量(SCI>5分)学术文章6篇,已授权专利5项,软件著作权27项;曾参与国家863项目1项、科技部十三五项目1项、全国多中心液态活检多中心项目1项。

张静波先生

本次沙龙分为四部分:出生缺陷基因检测现状及前景、NIPT PLUS企业入场门槛、NIPT PLUS产品未来要求,以及张老师本人对基因行业的看法。

NIPT,全名为:胎儿染色体非整倍体无创产前基因检测,它通常针对21-三体、18三体和13三体综合征进行检测,其中21三体综合征(唐氏综合征)造成的总经济负担每年就超过100亿元。目前NIPT的服务对象基数为1500万量级,认知接受度也已从原来的大都市全面沉底到县乡级,未来数年内渗透率有望从现在的30%上升到70%-80%,但是这三大三体综合征合计只占足月期胎儿出生缺陷总数的4%,并不能满足对出生缺陷的检测要求。随着现在孕妇的年龄和经济水平越来越高,社会需求驱动也需要一个更高质量和更加差异化的产品来代替NIPT产品。

除了T21/T18/T13三大染色体非整倍体以外,其他染色体非整倍体和染色体缺失重复综合征合计占比达到出生缺陷的30%,导致的很多疾病也比3大染色体非整倍体疾病更加严重。NIPT PLUS是NIPT的升级版,优势就在于它更广泛地涵盖了出生缺陷类型,可将囊括的出生缺陷检测范围从4%提高到34%,张老师认为:NIPT PLUS将(或正)成为生育健康的未来。国际产前诊断协会(ISPD)、美国遗传学会(ACMG)、中国卫健委均推荐对染色体微缺失微重复(CNV)进行报告。美国的三大主流公司Sequenoe、Natera、Roche,和国内包括华大基因、贝瑞基因在内的龙头公司也在NIPT的基础上增加了染色体数目异常和各类CNV合计约100种出生缺陷,但目前只有优迅的NIPT plus增加全部295个智力缺陷相关区域的检测,并将CNV的精度达到了2M的程度。

第二部分张老师讨论了NIPT plus的关键门槛。第一是技术迭代能力,NIPT用简单的z-test方法就可以判断,但plus检测小片段的CNV就对精度有很大的要求,如胎儿浓度过低的影响、背景噪音都会对检测结果造成很大的影响。plus最笨的办法就是加数据量,如果不加太高的数据量就需要用新的方法替代传统的方法,和背景降噪的方法,使性能达到一个稳态。第二个门槛是CNV的解读,需要积累更多中国人的出生缺陷数据库和临床专家的解读,我国2016年十三五重大专项就有对儿童常见基因组病和单基因病的标准建立内容,优迅有幸和301医院一起参与。第三个门槛,也可以说是未来最大的门槛是标准制定、合规性和试剂盒报批。NIPT曾被政府叫停、设立试点。Plus推出到现在三四年时间也是各家良莠不齐,国家肯定也要做整改,有之前NIPT的经验,留给我们的时间肯定更短,如果现在还没有启动试剂盒的申报准备,未来很难突破这个门槛。第四个门槛是市场布局,现在NIPT的渗透率大概30%,未来几年随着进医保和政府买单应该能到60%,市场规模达到60亿以上问题不大。而NIPT plus在试剂盒报批之后肯定会有一个质的飞跃,市场规模从现在不到10亿,可以增加到80-100亿的规模,未来plus的玩家不会超过现在NIPT的5家。

对NIPT PLUS未来产品的要求呢?可以总结为更快、更先、更全这三大要求的关键词。第一,大样本量规模化量产,追求全自动化和极致周期;第二,检测窗口要提前,现在的NIPT一般要求是11周以后,优迅正在通过胎儿片段富集+滋养层细胞取样两个方向争取做到在胎儿基本成型的第7周之前就检测出来;第三,从专注局部到全部,将基因组全部异常信息一网打尽。

随后,张老师发表了他对基因行业的看法,表示基因行业是目前极少数的从底层核心技术到顶层市场服务,都几乎不受国际影响,中国从硬实力到软实力都是国际并列甚至领先的战略新兴产业。后续各位参会的同仁们也纷纷踊跃提出问题。

错过了现场讲解、想要了解更多内容的同仁们,可通过点击回放链接:http://suo.im/5EJEq6。

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来源: 中华网科技 责任编辑:李小晓
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高圣沙龙第930期 · 出生缺陷基因检测的未来——NIPT PLUS

导读:3月20日,受疫情影响,沙龙依然在企业微信直播平台上进行。高圣沙龙来了一位人气颇高的大咖主讲,优迅医学轮值COO&生物信息总监张静波先生空降直播间。本次沙龙的主题为:出生缺陷基因检测的

3月20日,受疫情影响,沙龙依然在企业微信直播平台上进行。高圣沙龙来了一位人气颇高的大咖主讲,优迅医学轮值COO & 生物信息总监张静波先生空降直播间。本次沙龙的主题为:出生缺陷基因检测的未来——NIPT PLUS。

张静波先生拥有13年生物信息分析及遗传统计学学习及工作经历,主要研究方向为NGS应用型产品核心算法设计及基因组学大数据分析,带领团队完成中国耳聋基因单倍型分析、NIPT贝叶斯方法核心设计、基于常染色体胎儿浓度定量算法、ESRiT、TMB、信息熵疾病风险评估模型等核心算法,已发表高质量(SCI>5分)学术文章6篇,已授权专利5项,软件著作权27项;曾参与国家863项目1项、科技部十三五项目1项、全国多中心液态活检多中心项目1项。

张静波先生

本次沙龙分为四部分:出生缺陷基因检测现状及前景、NIPT PLUS企业入场门槛、NIPT PLUS产品未来要求,以及张老师本人对基因行业的看法。

NIPT,全名为:胎儿染色体非整倍体无创产前基因检测,它通常针对21-三体、18三体和13三体综合征进行检测,其中21三体综合征(唐氏综合征)造成的总经济负担每年就超过100亿元。目前NIPT的服务对象基数为1500万量级,认知接受度也已从原来的大都市全面沉底到县乡级,未来数年内渗透率有望从现在的30%上升到70%-80%,但是这三大三体综合征合计只占足月期胎儿出生缺陷总数的4%,并不能满足对出生缺陷的检测要求。随着现在孕妇的年龄和经济水平越来越高,社会需求驱动也需要一个更高质量和更加差异化的产品来代替NIPT产品。

除了T21/T18/T13三大染色体非整倍体以外,其他染色体非整倍体和染色体缺失重复综合征合计占比达到出生缺陷的30%,导致的很多疾病也比3大染色体非整倍体疾病更加严重。NIPT PLUS是NIPT的升级版,优势就在于它更广泛地涵盖了出生缺陷类型,可将囊括的出生缺陷检测范围从4%提高到34%,张老师认为:NIPT PLUS将(或正)成为生育健康的未来。国际产前诊断协会(ISPD)、美国遗传学会(ACMG)、中国卫健委均推荐对染色体微缺失微重复(CNV)进行报告。美国的三大主流公司Sequenoe、Natera、Roche,和国内包括华大基因、贝瑞基因在内的龙头公司也在NIPT的基础上增加了染色体数目异常和各类CNV合计约100种出生缺陷,但目前只有优迅的NIPT plus增加全部295个智力缺陷相关区域的检测,并将CNV的精度达到了2M的程度。

第二部分张老师讨论了NIPT plus的关键门槛。第一是技术迭代能力,NIPT用简单的z-test方法就可以判断,但plus检测小片段的CNV就对精度有很大的要求,如胎儿浓度过低的影响、背景噪音都会对检测结果造成很大的影响。plus最笨的办法就是加数据量,如果不加太高的数据量就需要用新的方法替代传统的方法,和背景降噪的方法,使性能达到一个稳态。第二个门槛是CNV的解读,需要积累更多中国人的出生缺陷数据库和临床专家的解读,我国2016年十三五重大专项就有对儿童常见基因组病和单基因病的标准建立内容,优迅有幸和301医院一起参与。第三个门槛,也可以说是未来最大的门槛是标准制定、合规性和试剂盒报批。NIPT曾被政府叫停、设立试点。Plus推出到现在三四年时间也是各家良莠不齐,国家肯定也要做整改,有之前NIPT的经验,留给我们的时间肯定更短,如果现在还没有启动试剂盒的申报准备,未来很难突破这个门槛。第四个门槛是市场布局,现在NIPT的渗透率大概30%,未来几年随着进医保和政府买单应该能到60%,市场规模达到60亿以上问题不大。而NIPT plus在试剂盒报批之后肯定会有一个质的飞跃,市场规模从现在不到10亿,可以增加到80-100亿的规模,未来plus的玩家不会超过现在NIPT的5家。

对NIPT PLUS未来产品的要求呢?可以总结为更快、更先、更全这三大要求的关键词。第一,大样本量规模化量产,追求全自动化和极致周期;第二,检测窗口要提前,现在的NIPT一般要求是11周以后,优迅正在通过胎儿片段富集+滋养层细胞取样两个方向争取做到在胎儿基本成型的第7周之前就检测出来;第三,从专注局部到全部,将基因组全部异常信息一网打尽。

随后,张老师发表了他对基因行业的看法,表示基因行业是目前极少数的从底层核心技术到顶层市场服务,都几乎不受国际影响,中国从硬实力到软实力都是国际并列甚至领先的战略新兴产业。后续各位参会的同仁们也纷纷踊跃提出问题。

错过了现场讲解、想要了解更多内容的同仁们,可通过点击回放链接:http://suo.im/5EJEq6。

东方高圣大健康并购公益沙龙,每周五一期,在线直播,风雨无阻,雷打不动,也是东方高圣坚持了十几年的老习惯。如果您对大健康领域并购感兴趣,欢迎您来讲、来听。授人以渔是厚德。

标签: [责任编辑]:李小晓
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